1、根据情况决定：从食物口味上来看 莲子味道甘甜，而莲子芯味道发苦，对于不爱吃苦的人来说，不带芯食用口味更好，不过一般新鲜莲子芯较嫩，带芯吃口味也还好，但干制莲子用的成熟莲子，其芯较苦，炖煮食用一般去芯吃为主，买到的成品也基本是去芯处理好的。
2、从食用药效上来看 莲子心性寒，具有较强的清热降火功效，带芯食用适宜夏季清热解暑、平时上火食用，其食疗效果会更好，尤其是直接用莲子芯泡水喝清热解暑更胜一筹。
3、从食用人群上来看 不带芯的莲子性平，适宜大部分人食用，而带芯的莲子寒性强，对于体寒、经期、腹泻、脾胃虚寒等人群来说都是不宜吃的，否则对健康不利。