1、有学者认为三长两短指的是未盖上盖儿的棺材，因为棺材正好由三块长木板、两块短木板构成一个匣子。棺材是用来装死尸的，“三长两短”在口语中常指意外的灾祸、有生命危险的事故，或许与此有关。“三长两短”指棺材的说法不无道理，但仔细推敲一下，人死后棺材岂能不盖上盖儿？且不说盖棺论定，不盖之棺焉能下葬？可是盖上盖儿那就不是“三长两短”而是四长两短了，或许另有他解。
2、另一种说法为：铸剑大师欧冶子(约公元前514年前后，春秋末期到战国初期越国人）铸过“三长两短”五把名剑：纯钧、磐郢（又名胜邪）、湛卢、巨阙和鱼肠。其中纯钧、磐郢（胜邪）和湛卢为长剑，巨阙和鱼肠为短剑。三长两短五把剑全都锋利无比。历史上有专诸刺王僚的故事，说的是剑客专诸，受吴公子光收买，要刺杀吴王僚。僚王爱吃烤鱼，专诸就假扮厨师，手托鱼盘，鱼肚子里就暗藏利刃，趁机刺杀了僚王。那把锋利的短剑就被后人称作鱼藏剑，
3、再有一个说法是说人的五个手指；大拇指和小拇指是两边短；食指.中指和无名指是中间长。从前有个人突发疾病住院了，病人家属询问医生；医生伸出五个手指，病人家属看后哭了。三长两短则成了意外灾祸的代名词。