1、科属不同：鲅鱼是鲈形目鲅科马鲛鱼属海鱼；秋刀鱼是颌针鱼目竹刀鱼科秋刀鱼属表层洄游性鱼类。
2、外形不同：鲅鱼体长侧扁，体长25～50cm左右，整体呈银亮色，口大嘴尖突，背部上有黑蓝色斑点或暗色的条纹，游起来迅速；秋刀鱼体细长侧扁，体长35cm左右，头较长，背部及侧上方呈暗灰青色，背部中央有1根微弱棱线，腹部呈银白色，且体侧中央有一根银蓝色纵带。
3、分布范围不同：鲅鱼分布在北太平洋西部，在我国的渤海、黄海、东海等地也有分布；秋刀鱼分布在北太平洋区，国外多分布于白令海、日本海、墨西哥、阿拉斯加、加利福尼亚州等海域，在我国的黄海及山东东岸地区分布较多。
4、功效不同：鲅鱼具有补气、补血、提神、防衰老的效果，非常适合营养不良、产后抑郁、神经衰弱或贫血的患者食用；秋刀鱼具有降压、预防肝硬化的效果，非常适合患有高血压、动脉肝硬化、心肌梗塞的患者食用。