1、不同科属不同：
（1）草果：草果为植物界、被子植物门、单子叶植物纲、姜目、姜科、豆蔻属植物的果实。
（2）罂粟：罂粟为植物界、被子植物门、双子叶植物纲、原始花被亚纲、罂粟目、罂粟科、罂粟属植物的果实。
2、不同外观：
（1）草果：草果属于不开裂蒴果，果壳上有棱线，壳纹路比较明显，整颗果实比较皱，内有20-66粒籽种。种子为多角形，每个种子颗粒被一层白色海绵状薄膜所包住，种仁白色，有浓郁的清香辛辣味。
（2）罂粟：罂粟呈长圆形，棕色，果壳上有棱线，顶端有圆盘状的残留柱头，棱线整体平滑，种子多数，黑色或深灰色，表面呈蜂窝状。
3、不同功效：
（1）草果：草果药用价值很高，具有燥湿除寒、祛痰截疟、健脾开胃、利水消肿的功效。对于疟疾、痰饮痞满、反胃、泻痢、食积等症都有治疗效果。
（2）罂粟：罂粟虽然有毒，但也有一定药用价值。具有敛肺、涩肠、固肾、止痛的功效，可以治疗久咳劳嗽、喘息、脱肛、遗精、白带及筋疼痛等多种症状。