1、优点不同，火鸭：产蛋率高繁殖快，耐粗饲（以草食为主），适合旱养圈养，有较高的肉用、药用、观赏等价值。番鸭：具有体型大、生长迅速、耐粗饲、易肥育、肉质鲜美、产肝性能好等优点。
2、饲养条件不同，火鸭：饲养条件要求不高，抗病力强，比较容易饲养成功。番鸭：在当前农村低饲养水平的条件下，体型偏小，生长嫌慢，产蛋也偏少。
3、产地不同，火鸭：产自云贵高原。番鸭：原产于中、南美洲热带地区，主产于湖北阳新县，福州市郊和龙海等地，分布于福清、莆田、晋江、长泰、龙岩、大田、浦城等市县，在江浙沪皖部分地区亦有产区。