1、南瓜的瓜瓤含糖量较高，如果储存的时间过久，会发生无氧酵解，产生酒精，人食用后不利于身体健康。食用久存的南瓜时，要细心检查，如南瓜散发出酒精味或已腐烂，切勿食用。
2、南瓜也有可能成为过敏原，所以对南瓜过敏的人不宜吃南瓜粥。对南瓜过敏的人食用南瓜就可能造成皮肤红肿、经常性腹泻、消化不良、头痛、咽喉疼痛、哮喘等过敏症状了，所以此类人群要避免食用南瓜及南瓜制品。
3、南瓜性温，多吃会助长湿热，所以胃热炽盛者、气滞中满者、湿热气滞者应少吃，同时患有脚气、黄疸、气滞湿阻病者忌食。以上人群在选择食用南瓜或者是南瓜制品的时候需格外谨慎。