1、本草中国第一季：从南到北、自西向东，从广东化橘红到东北野山参，从西藏红景天到崇明西红花，从新疆红花到内蒙古甘草，摄制组在本草的引领下，探寻隐没于山林、高原、戈壁、沙漠等不同地域的中药人与本草的动人故事。《本草中国》采用主题式分集，主题“问药”共包括《境界》《时间》《分寸》《相遇》《双面》《年华》《沉浮》《解构》《本草地图》等10集正片，每集围绕一个既定主题展开，从现代人生活的角度出发，寻找符合内涵的相关中药材。
2、本草中国第二季：节目延续以“本草”要素，讲述的是本草的功能和用法。相对于第一季对本草药采摘、炮制、配伍的环节和流程展示外，第二季将“用药”作为故事的核心，通过本草把医生与患者的故事串联起来。在独特的中国传统文化视角下，用传统中医药哲学“天、地、人”的思想统领全片，从而理解中医药中相互交织相互影响的伟大哲学命题内核。