1、孕妇
蜂巢含有一定量的激素和类激素成分，例如黄酮类化合物就有雌激素样作用，而孕妇体内的激素平衡非常微妙(例如雌激素和孕激素，孕妇体内的雌激素相对比较高，但雌激素会被孕激素拮抗掉，正常情况下两者处于动态平衡状态)，若食用蜂巢则可能破坏体内的激素平衡，轻者可能刺激子宫而引起宫缩，重者甚至可能导致流产，因此孕妇不能吃蜂巢。
2、过敏体质人群
蜂巢虽然大部分人群都可食用，但对于小部分过敏体质者(免疫系统存在缺陷，容易“不辨敌友”的进行无端攻击)而言蜂巢也是可能导致过敏的，尤其是蜂巢中存在的花粉及大分子蛋白质等成分极易成为过敏原，这些人在食用后可能出现胸闷、心悸、呼吸困难及脸色涨红等过敏症状(可服用扑尔敏、赛庚啶等抗过敏药物)，因此过敏体质者不能吃蜂巢。
3、婴幼儿
蜂巢不适合婴幼儿食用的原因主要有两个方面，其一是蜂巢中可能含有肉毒杆菌(毒性最强的细菌之一)，对于成年人而言食用带肉毒杆菌芽孢的蜂巢不会产生危害，但婴幼儿的大肠则非常适合肉毒杆菌芽孢的生长，其二是蜂巢含有的某些成分对成年人来说可以调节免疫功能，但免疫功能尚不完善的婴幼儿服用则可能会影响免疫系统的正常发育和完善。
4、免疫低下者
免疫系统是人体健康的“基石”，没有免疫系统的保驾护航则极容易生病且生病后很难治愈，为什么说蜂巢适宜免疫低下的人群食用呢？主要源于蜂巢中含有酶类及矿物质成分可以调节机体免疫功能，另外蜂巢中含有的脂肪酸及有机酸能增强免疫细胞的活性并能调节机体的特异性和非特异性免疫功能，因此免疫低下、体弱多病的人比较适宜吃蜂巢。
5、局部炎症者
炎症最主要的原因是致病菌引起的感染，而蜂巢中富含的抗菌成分对绿脓杆菌、痢疾杆菌、大肠杆菌、伤寒杆菌等有极强的抑制和灭杀效果，而对烟曲霉、黄曲霉、明串珠菌等真菌也有抑制作用，同时蜂巢中含有的球蛋白、王浆酸及氨基酸等成分可以有效的提高机体的免疫功能，因此局部炎症如鼻炎、牙周炎及鼻窦炎等患者比较适合吃蜂巢来消炎。