1、生长环境不同。
基围虾是广温广盐性虾类，广泛栖息于沙底、沙泥底、泥底的海区，在沿海50米等深浅范围内均有分布，而以10米内数量较多，也就是海虾。
凤尾虾用的是河虾，广泛分布于我国江河、湖泊、水库和池塘中的河虾（又称青虾，学名叫日本沼虾（Macrobranchium nipponense）），是优质的淡水虾类。
2、指代范围不同。
基围虾指的是一类虾的品种，用做指代，有好几个种类。
而凤尾虾是一道是南京的传统菜肴，金陵菜（京苏大菜）的代表之一，与松鼠鱼、蛋烧卖、美人肝并称为“京苏菜四大名菜”。
3、种类不同。
基围虾指的是刀额新对虾，包括有泥虾、麻虾、花虎虾、虎虾、砂虾、红爪虾、卢虾，商业上称基围虾。凤尾虾指的就是在河里生长的那种。