1、新鲜的羊肚菌是可以冷冻保存的。将新鲜的羊肚菌放入冰箱的冷冻层内，羊肚菌就会结冰保存，这样可以让新鲜的羊肚菌保存一个星期左右。
2、将新鲜的羊肚菌放入冰箱的冷藏层中，可以保存一到两天左右，最好是尽快吃完，这样可以避免羊肚菌变质。
3、新鲜的羊肚菌还可以晒干保存。将买回来的新鲜的羊肚菌放在阳台上，晾晒几天后，就可以装在塑料袋内保存。
4、将羊肚菌放在真空袋中，用真空机压缩处理，挤压走里面的空气。真空处理羊肚菌可以保存更久一些，大概两个星期左右，不过这个期间也要尽快食用。
5、羊肚菌还可以放在阴凉处保存，最好是不要被光照射到，温度也不适合太高，这样保存的羊肚菌，能够存放一天左右。
6、羊肚菌还可以用盐腌制，如果之后要吃，可以直接将其取出来，这个方法保存的羊肚菌，可以放置更长的时间。
7、烘干保存也是一个不错的方法。将新鲜的羊肚菌用烘干机烘干保存，之后再放入塑料袋中。