1、外观不同。荠菜和芥菜虽菜名相像，但其外观却大有不同。首先，芥菜别名雪菜，形状是小白菜似的，是十字花科植物。而荠菜的叶子呈分散的片状，并且带有锯齿，而且味道独特，也可以靠味道来分别二者。
2、营养价值不同。在营养成分上，荠菜和芥菜也不同。芥菜含有维生素A、维生素B、维生素C、维生素D、胡萝卜素、还有钾、钙、磷等矿物质元素。荠菜含有丰富的膳食纤维，荠菜的食物纤维含量高达1.7mg/100g。以及各种维生素和矿物质。此外，还含有胆碱、乙酸胆碱、芥菜碱、黄酮类等成分。
3、功效不同。芥菜有提神醒脑，解除疲劳的作用。除此之外，还有解毒消肿、抗感染和预防疾病的发生的功能。而荠菜也不逊色，具有明目、健脾的功效，以及增强机体免疫功能。荠菜还具有降血压的功效。