1、冷藏保存：将新鲜的羊肚菌放在冰箱的冷藏层里，可以保存一到两天左右，之后就要尽快食用，避免羊肚菌变质。
2、冷冻保存：可以将新鲜的羊肚菌放在冰箱的冷冻层里，使羊肚菌冷冻结冰保存，这个方法可以使新鲜的羊肚菌保存一个星期左右，其间要尽快食用，以免破坏了新鲜羊肚菌的口感。
3、晒干保存：将买回来的新鲜的羊肚菌放在阳台有太阳的地方，晾晒几天，晒干后，就可以装在塑料袋里保存起来了。
4、真空袋保存：将羊肚菌放在真空袋里，然后用真空机压缩处理，挤压走里面的空气。真空处理的羊肚菌可以保存得更久一些，大概是两个星期左右，不过也是要尽快食用的。
5、阴凉处保存：把新鲜的羊肚菌放置在阴凉处，不要被光照射到，温度也不能太高。这样保存的羊肚菌，也可以保存放自己一天左右。
6、腌制保存：把新鲜的羊肚菌用生盐腌制起来，之后要吃的话，就直接把它取出来，用这种方法保存的羊肚菌，可以放置得比较久一些。
7、烘干保存：将新鲜的羊肚菌用烘干机烘干保存，之后再放进塑料袋里。因为这样一来羊肚菌就没有了其中的水分，所以可以放置保存一段比较久的时间的。