1、调节途径不同
应激反应主要是有害刺激通过下丘脑-腺垂体-肾上腺皮质系统引起的；应急反应则是通过交感-肾上腺髓质系统引发的。
2、作用各有侧重
应激反应主要是通过糖皮质激素发挥作用，减少有害刺激引起的一些物质如缓激肽，蛋白水解酶、前列腺素等的产生，减轻它们的某些不良作用，具有抗炎、抗毒、抗过敏、抗休克等作用；应急反应则主要是通过交感神经系统及肾上腺素发挥作用，提高中枢神经系统兴奋性，加强循环、呼吸等功能，有利于机体保持觉醒和警觉状态，增强抗疲劳作用，迅速做出逃避或应战反应，承担巨大体力和脑力劳动。
3、反应速度有差别
应激反应是引发代谢改变和其他全身反应，提高应激能力以维持生命活动，反应较为缓慢；应急反应是紧急动员，即刻行动，故反应迅速。
4、刺激程度有区别
如感染、中毒、麻醉、手术、创伤、缺氧、饥饿、疲劳、精神紧张、环境温度剧变等主要是引起应激反应，使机体能忍受并应付应激刺激及其危害；对剧烈运动、剧痛、恐惧、失血、窒息、情绪激动、暴冷暴热等突变性刺激，则主要引起应急反应。