1、低温保存法；将干透的天麻用塑料袋装好，放入冰箱冷藏柜内。这样一来可以防天麻在冰箱内受潮，二来也可以避免冰箱内物品串味，或药味走失。如天麻未干，应先干燥后再放入冷藏柜内。
2、干燥保管法；在可密闭的缸，筒，盒的底部放适量的干燥剂，如生石灰，木炭，硅胶等，使保存环境干燥。再将天麻用纸包好放入，加盖密闭，可防虫蛀，霉变。应保证干燥剂不会与天麻直接接触。
3、阳光曝晒法；对于已生虫的天麻也不要丢弃，可以先轻轻敲打以除去虫卵，虫尿及虫体，再臵阳光下曝晒或50℃?烘烤，以杀死虫卵和虫体。
4、常规保存法；对确已干透的天麻，可用塑料袋密封以隔绝空气，置阴凉处保存即可。已经潮湿的天麻，收藏前，还是要晾干，用白纸罩住天麻，照射阳光，白纸可以防止变色，日晒最佳时间上午9点-中午12点，天麻不宜长时间日晒，每天晒2个小时左右，冷却后，再收藏。
5、天麻最好是在一年内食用完，保存久了效果会打折。对于已生虫的天麻，可以将天麻冷冻，或高温蒸气杀死虫卵，然后晒干保存即可。