1、杀菌灯不能直接放置在鱼缸里，也不能和过滤器材放一起。因为它会伤害鱼儿，也会杀死鱼缸中的硝化细菌。杀菌灯应该放在鱼缸出水口，就是在过滤之前先让水经过杀菌灯，然后再经过过滤器材。 我们较常见的是放在底滤鱼缸的水泵旁边，这样也有一定的效果。有条件的，还应该给杀菌灯配一个功率低的水泵，尽量让鱼缸的中水都经过杀菌灯，这样才可以有效的发挥它杀菌除藻的作用。
2、杀菌灯不必要每天24小时都开着，每天使用两个小时左右的时间就可以了。长时间开着会对鱼缸中的有益菌有一定的影响，同时还会减短其使用寿命。
3、如果鱼缸中正在放药水治鱼病，请一定关闭杀菌灯，这样做是为了避免紫外线和药物产生不良反应。