1、除了极品紫水晶外，大部分紫水晶内部都含有杂质，如棉、冰裂、内包物等，而合成的没有，不过也有种叫养晶的东西，内部可以发现小气泡；如果里面几乎不含杂质，就要考虑是否是合成紫晶了。
2、天然水晶的颜色不会很均匀，同一个手链上不同的珠子，甚至一个珠子上都可能颜色不均一，尤其是放在水里，能明显看出来，而合成的，颜色都比较均一。放在灯光下看，里面如果有很小的圆圆的小气泡，那是玻璃的，颜色很均匀，内部没有棉絮或冰裂，那是合成的。
3、划玻璃，玻璃花了，水晶没事，那就是真的。反之，水晶花了，那就是假的了，因为天然水晶石的硬度比玻璃大，天然水晶尤其紫水晶，里面会有棉絮，紫水晶里面的棉絮会发白色，有冰裂纹，就象里面裂开了一样。
4、用头发丝检查。将水晶放在一根头发丝上，人眼透过水晶能看到头发丝双影的，则为天然水晶，主要是因为水晶具有双折射。
5、天然紫水晶往往会有色带，而合成的紫水晶是不会有的。天然水晶手链，很透，裂隙很少，但是可以看见明显的色带。