制作调解协议书应当注意的问题是:
第一，调解是在企业劳动争议调解委员会的主持下进行的，因此，该法律文书的主体是争议的双方当事人和企业劳动争议调解委员会，调解书上必须有三方的.签名盖章确认后方为有效。
第二，在企业劳动争议调解委员会的组成上，应当由职工代表、企业代表、企业工会代表组成。职工代表由职工代表大会选举产生，企业代表由厂长、经理指定，企业工会代表由企业工会委员会指定。
调解委员会组成人员的具体人数由职工代表大会提出并与厂长、经理协商确定，企业代表的人数不得超过委员会人数的三分之一。调解委员会主任由企业工会代表担任。
第三，根据有关规定，当事人如果要将纠纷提交企业调解委员会调解的，应当在知道或者应当知道其权利被侵犯之日起30日内提出申请。
第四，企业调解委员会的调解不是必经程序，而且，只有在争议的双方当事人都同意由企业调解委员会调解时，调解委员会才可以主持调解。
第五，调解委员会在查明事实、分清是非的基础上主持调解，调解达成协议的，制作协议书。协议书中应当写明当事人的姓名(或者企业全称及法定代表人)、争议事项、调解结果等，然后由调解委员会负责人和双方当事人签名盖章，加盖调解委员会的公章。协议书一式三份:调解委员会、双方当事人各执一份。
第六，双方当事人达成调解协议后，当事人应当自觉履行协议书中规定的内容，企业调解委员会也应当督促当事人双方履行协议。协议没有法律约束力，即如果一方拒不履行协议内容，另一方当事人只能向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
第七，企业的劳动争议调解委员会同样存在申请回避的情形。根据有关规定，当调解委员会成员是争议双方当事人或者当事人的近亲属时、与劳动争议有利害关系时、与劳动争议有其他关系，可能影响公正调解时，当事人均有权申请其回避。
劳动争议调解协议书范本
申请人：姓名(或用人单位名称) _______________ 性别__________________
地址 _________________________________ 职务(岗位)__________
法定代表人____________________________ 职务__________________
委托代理人____________________________
被申请人：姓名(或用人单位名称) _______________ 性别__________________
地址 _________________________________ 职务(岗位)__________
法定代表人____________________________ 职务__________________
委托代理人____________________________
(事由)
上列双方因______________引起争议，申请人_______于_______年_______月_______日向本调解委员会提出请求，经本会主持调解，双方协商，自愿达成协议如下：
(协议内容)
1. ____________________________________________________________________________________。
2. ____________________________________________________________________________________。
3. ____________________________________________________________________________________。
双方当事人(签名)______________
调解委员会主任(签名)__________
劳动争议委员会(公章)__________
____________年_______月_______