实行“平行志愿”各批次投档时，按院校志愿组顺序投档。即先进行第一院校志愿组投档录取，第一院校志愿组录取结束后，再进行第二院校志愿组投档录取。
每个院校志愿组实行“平行志愿”。“平行志愿”投档原则为“分数优先，遵循志愿”，按考生排序情况从高到低检索，排序高的优先检索，再按考生填报的A、B、C、D、E、F、G、H、I等院校志愿依次逐个检索投档。即投档时，分文史类、理工类将考生按排序原则从高分到低分排序检索，然后按志愿顺序依次检索考生填报的A、B、C、D、E、F、G、H、I等志愿，如果考生符合A志愿院校的投档条件，则投档A志愿院校，如果达不到A志愿院校的投档条件，则继续检索后续的B志愿……依此类推。考生档案一旦投出，不再检索考生的其他志愿。
实行“平行志愿”各批次投档分预投档和正式投档。预投档在第一院校志愿组正式投档前进行，只提供生源基本情况。正式投档为高校提供考生电子档案。正式投档时，省招生办公室根据高校最终确定的招生计划及投档比例(1︰1)，按规定的投档原则进行投档，即根据考生排序情况，从高到低逐个检索考生，排序高的优先按其院校志愿从A院校到I院校的顺序依次检索，被检索的志愿中一出现符合投档条件的院校，即向该院校投档。同一院校排序并列的考生全部投档。
平行志愿投档各组志愿及征集志愿均为一次性投档，缺档院校不即时补档，待下一组志愿或征集志愿时再行投档。
第一组院校志愿录取结束后，未完成招生计划的院校，进行第二组院校志愿的投档、录取。第二组院校志愿投档时不再预投档，按缺额情况1︰1比例投档。第二组院校志愿录取结束后，仍未完成计划的院校视情况安排征集志愿。
报考少数民族班和各类预科班的考生，于相应批次平行志愿投档结束后进行投档，由高校择优录取。
平行志愿就是在同一个志愿顺序上设置了两个以上(含)的并列院校志愿。
平行志愿的主要特点：一是强化了分数的作用，大大减少了高分低就、高分落榜现象;与此同时，低分考生侥幸高就的机会几乎没有了。二是降低了院校录取数据的年度波动幅度，出现“大小年”现象的几率小了。三是院校录取分数区间扁平化了，即最高录取分与最低录取分的差值小了。四是增加了考生第一志愿的录取概率，降低了志愿填报难度和报考风险。
1、各省招办会按照理工类、文史类考生按照分数从高到低排序，每一个考生每一批次(一本、二本、三本)可以填报3-5个志愿(A、B、C、D志愿有顺序之分但是都属于第一志愿)。
2、按照从每一批次第一名到最后一名考生的顺序进行志愿检索，以第一批次理工类排名第500名的考生为例，首先系统看他的A志愿(如华中科技大学，假如华中科技大学今年录取100人)，如果前面的499名同学没有超过120人的档案已经分到华中科技大学的话，该同学的档案就投到华中科技大学。(存在有些不服从调剂退档的同学，为了保证可以录取到100人，在投档的时候会多投一定比例档案，一般是按照1：1.2比例，也有省市按照1：1.05比例等)
3、但是如果前面已经超过有120人的档案已经分到华中科技大学，满额了，那么系统按照刚才的顺序再来看该考生的B志愿(如武汉大学)，如果武汉大学有名额，该考生档案就投到武汉大学，依次类推，如果A、B、C、D志愿都无法投出，那就等征集志愿。
4、如果投档到了某一志愿(B志愿)的学校，但是因为某专业不服从调剂或者身体等原因无法被B志愿学校录取，也会被退档进行征集志愿。
说明：因为志愿是计算机检索好后同时投递到各大学的，如果你的档案投到某一大学(B志愿大学)却因为上面第3点中说的原因被退档，是不会再进行检索你剩下的C、D志愿的，同时高校只能看到考生填报自己高校的志愿，看不到考生填报的其他志愿情况，所以对于高校来说，所有投档来的考生都是第一志愿报考该校。如果考生分数相同，则按照语、数、外单科排序投档，有些省市也会按照其他顺序投档。
平行志愿投档技巧
1、正确参考往年招生高校录取平均分和位次。
高校录取统计数据中，有最高分、平均分、最低分等数据。这三种数据对考生来说，平均分最有参考价值。参考高校录取平均分尤其是各专业平均分比参考最低、最高分更有效。
考查分差更具有可比性，对院校专业选择更有把握，简单易行，也是比较常用的方法。分差=考生成绩-批次录取控制线。
需要特别提醒考生的是，在参考拟报高校往年的录取平均分数线时，不能仅参考其前一年的录取分数，而要综合分析该校近三年的平均录取分数线。
2、合理安排院校梯度和顺序。
如何把握平行志愿之间的的'梯度?考生和家长不妨参考“口诀”——“冲一冲、稳一稳、保一保、垫一垫”。冲一冲：把有希望够得着的理想学校作为A志愿;稳一稳：把与自己成绩“门当户对”的学校作为B志愿;保一保：把比自己成绩稍低点的学校作为C志愿;垫一垫：将D志愿学校作为垫底学校。这样的话，几所学校就形成了梯度配置顺序。不过，要注意的是，“冲一冲”要慎重，要有一定把握，而不是盲目乱冲。
3、了解专业内涵，注重专业冷热搭配。
从往年实施平行志愿的地区招生情况来看，考生的考分情况非常扁平：很多学校录取的最高分和最低分差距缩小了，热门专业和优势专业可能出现“挤爆”现象。建议考生在具体的志愿填报中，专业也要适当安排梯度，更加重视专业冷热搭配，拉开专业落差。如果首选学校，要做好适当降低专业要求的准备;如果首选专业，则要做好降低对学校要求的准备。
4、谨慎对待“服从调剂”
考生如果确认“服从调剂”，一方面可增加录取的机会;另一方面极可能调剂录取的学校和专业，不是你愿意就读的学校和专业。因此，考生既要充分重视，又要慎重对待。