1、产权年限短：公寓一般都是建在商业用地或者工业用地上，公寓房的产权年限大多为50年或者40年。
2、落户成难题：部分公寓是在商业用地上建起来的项目，是商业性质的，不符合落户的规定，因此不能落户。
3、税费高转手难：根据我国的相关政策，普通商品房二手交易时可免收土地增值税，但商用公寓交易时不免交土地增值税，还需交纳增值税、各项税费因此转手难。
4、居住的人多：公寓大多是小户型，所以梯户比通常是两梯十户，居住的人员多且杂乱，生活的安全性和私密性都无法得到很好地保障。
5、居住成本高：公寓房的水电费都是按商业用电的标准缴纳，所以购买公寓房的居住成本是比较高。
6、通风不佳：由于户型小的原因，公寓房的厨房一般为开放式，容易产生油烟味。