1、三峡影响是指近年来中国频现异常气候，西南大旱、重庆酷热、两湖流域暴雨等，三峡时常成为矛头所指。在互联网上，网民提出“三峡诱发干旱论”，称三峡工程是造成2011年长江中下游罕见大旱的罪魁祸首。
2、三峡水库库容极大，因此必然会增加库区地震的频率，由于三峡两岸山体下部未来长期处于浸泡之中，因此发生山体滑坡、塌方和泥石流的频率会有所增加，这将是三峡工程所能造成的主要地质灾害。而工程支持者只考虑了地质的静态状况，没有考虑蓄水后可能带来的地质条件质变。
3、地质灾害：专家称，三峡水库建成后，逐步淹没了大量地势低洼的山体，包括城市、集镇和村庄，长期浸泡使被淹的山体等发生松软并冲入了低洼的采矿采空区，这都会导致库岸坍塌、山体滑坡等。此外，三峡水库每逢冬季蓄水、每逢夏季（汛期）放水，水库水位的周期性涨落，也对沿库地区造成压力，会诱发多种地质灾害。
4、雷击事件：2007年4～8月，库区及其邻近地区特别是重庆地区多次发生雷击事件，共造成21人死亡，灾害损失较往年偏重。其中，4月1日重庆市垫江、綦江雷击事件造成5人死亡；5月23日重庆市开县义和镇兴业村小学雷击事件造成7名小学生死亡，重伤19人，轻伤25人。大风、冰雹：2007年，库区及其邻近地区大风、冰雹等强对流天气频发，点多面广，时间跨度大，从春到夏接连发生，造成的灾害损失重于上年。据统计，共50多个县次先后遭受了大风、冰雹等局地强对流天气袭击，造成3人死亡，230多万人受灾，房屋损毁8.3万多间，因灾经济损失超过3.8亿元。
5、大雾：2006/2007年冬季及深秋，库区西部大部地区频繁出现大雾天气，使高速公路、铁路、民航、河运等交通运输受到不同程度影响，给人们春节出行造成了不便，同时引发了重大交通事故，导致了空气质量下降，影响人体健康。2月7日，湖北恩施州鹤峰县路段因阴雨和大雾发生一起16人死亡、16人受伤的特大交通事故。11月9日，大雾封锁重庆机场，仅1小时就造成30个进出港航班延误，4个航班被迫取消，4000名旅客滞留机场；成渝高速、渝宜高速等8条高速路先后实施交通管制；水运朝天门三渡轮航线禁航4小时。
6、干旱：2007年，库区干旱总体较轻。2006/2007年冬季，受上年夏季川渝特大高温干旱的后续影响，重庆市水库蓄水和稻田蓄水明显偏少、江河水位普遍在水位低值区徘徊、地下水急剧下降，重庆全市水利工程蓄水量不到历史同期应蓄水量的50%，全市有150万人、98万头大牲畜出现临时饮水困难，农作物受旱11.6万公顷，库区部分地区工农业生产和生活用水出现困难。最近长江中下游地区遭遇50年来罕见干旱，让人们的聚焦点再次投注在三峡工程上。5月18日，国务院常务会议讨论通过2009年就已开始启动编制的《三峡后续工作规划》。