1、外形。芦柑和丑橘在外形上是有着比较明显的区别的，芦柑的个头比较大，整体呈现出比较规整的球型，果皮一般不会凹凸不平，且海绵层很厚，而丑橘的个头稍小一些，整体形状不算规整，果皮凹凸不平，且比较容易剥开。
2、口感。丑橘和芦柑在口感上也是有一定的差异的，丑橘的果肉橙黄色，绵软多汁且口感整体脆甜，比一般的橘子的甜度要高且甜味明显，而芦柑的味道更偏向微酸一些，酸甜爽口，甜度有时候会比橘子还要低一些，但不容易变质。
3、营养基质。丑橘的果肉中含有大量的维生素C，以及各种人体所需要的微量元素，其具有生津止渴，化痰理气的功效，营养价值远超一般的橘子，且能够入药，而芦柑含有大量的矿物质和维生素、果胶等，能够分解脂肪、降低胆固醇和排出重金属。
4、植株特点。丑橘和芦柑是有很多的相似之处的，这包括其果实的相似也包括母株的相似，这是因为柑橘属的植株在形成现在的族群之前，彼此经过了多次的重复杂交，都混入了别的植物的性状，因此其体内的性状具有高度的相似性。