1、烘干保存。虫草花需要烘干后保存，首先将虫草花进行烘干，然后放置在密封的塑料袋中，虫草花水分含量低能够抑制细菌和微生物的滋生，再将虫草花放置在阴凉通风处存放即可。
2、冷藏保存。虫草花可以冷藏保存，将虫草花使用保鲜膜包裹，然后放入冰箱的冷藏区中，冷藏区温度较低，能够一定程度上抑制细菌的滋生，并且保鲜膜可以隔绝虫草花和空气的接触，即可延长虫草花的存放时间。
3、阴凉处存放。虫草花可以放置在阴凉处保存，首先将虫草花清洗干净，然后沥干水分，在水盆上放一个铁网，将虫草花放置在铁网上，然后将水盆搬至阴凉通风的地方，即可推迟虫草的变质时间。