1、坏处：睡回笼觉易致内分泌紊乱。睡回笼觉会打乱人生物钟节律。正常的人体的内分泌及各种脏器的活动，有一定的昼夜规律。这种生物规律调节着人本身的各种生理活动，使人在白天精力充沛，夜里睡眠安稳。如果平时生活较规律而到假期睡回笼觉，会扰乱体内生物钟节律，使内分泌激素出现异常。长时间如此，则会精神不振，情绪低落。睡回笼觉导致记忆力下降。如果本身睡觉时间比较长， 还经常喜欢睡回笼觉的人容易头昏脑胀、记忆力下降。这是因为一夜休息后继续睡回笼觉会导致睡眠中枢长期处于亢奋状态，而其他神经中枢由于受到抑制时间太长，恢复活动的功能就会变得相对缓慢，因而会感到终日昏昏沉沉、无精打采，甚至记忆力下降。睡回笼觉导致胃肠功能紊乱。睡回笼觉会影响胃肠道功能。一般早饭在7点钟左右，此时晚饭的食物已基本消化完，胃肠会因饥饿而引起收缩。爱睡回笼觉的人宁愿肚子饿也不愿早起吃早饭，时间长了，易发生慢性胃炎、溃疡病等，也容易发生消化不良。
2、好处：补充睡眠，恢复体力。对于上夜班或者通宵的人来说，睡个回笼觉是非常有必要的，而且还可以用来补充睡眠，进而恢复体力，所以回笼觉对于健康是有好处的。改善精神和情绪。事实证明，有的人睡一次“回笼觉”，白天的精神和情绪常能保持良好，也不会出现明显的困倦。清晰思维。已故台湾商界巨子、台塑集团前董事长王永庆(享年91岁)，长期也有睡“回笼觉”的习惯。据其介绍，他每天清晨6点半至8点左右，会睡上一个“回笼觉”。他睡时通常香甜，醒来头脑清明，非常舒服! 王永庆一直身体硬朗、精力旺盛、思维敏捷，可能与此也有一定关系。抑制兴奋，预防疾病。有的人在晨醒后，大脑并没有马上处于正常的兴奋状态，而是由抑制状态向兴奋状态过渡，此时大脑高级中枢会发出重新进入浅睡眠信号，即重新睡小觉。此时如睡上一个“回笼睡”(不需太长时间)，当醒来后，大脑神经活动经过重新调整，一些处于抑制状态的大脑神经开始活跃或兴奋，最终使人彻底清醒过来。不睡“回笼觉”，有可能会感到头晕、头胀痛、血压不稳，有的还可能诱发脑血管疾病等。