1、产地不同：普通柚子品种繁多，而且还有不少杂交品种。江浙栽培较多的有：四季泡、古磉红柚，产自平阳；南港柚，产自瑞安、平阳；柚子在东南亚各国也有栽种。文旦柚，产自玉环，而文旦柚并不多见，关西蜜柚和广西沙田柚较多一些。
2、外形不同：普通柚子果形偏扁、偏大，肉质颗粒也比较大，果色偏黄，果皮较厚，呈黄色。而文旦的果形上小下大，较为修长，有点像葫芦，果色绿中泛黄，果皮较薄，呈浅绿色。
3、口感不同：普通柚子切开时有柠檬酸味，口感略带苦味。而文旦的果肉中籽很小较少，果肉更为细嫩甘甜多汁。
4、价格不同：普通柚子比较便宜，文旦的价格要贵一些。