1、烘焙效果不同
微波炉可以让食物快速翻热，然而在加热过程中，食物本身的水分及营养成分也会随之减少。而烤箱的加热方式既不会破坏食物原有的美味，还可保留食物中所含有的水份和营养成分，所烹制的食物外酥内嫩，也比较适合东方人的口味。
2、加热原理不同
微波炉通电后，电能会变成微波，通过炉内的空气传播到食物，然后使得食物内部每一个分子都进行热运动，使得食物变热直至成熟。 电烤箱 则是让电阻丝通电变热，使电能变成热能，使得箱体内的温度提高，继而对食物进行烘烤至熟，这个过程是由外至里的。
3、侧重点不同
烤箱大多是用来烘焙食物的，比如面包、蛋糕、比萨、烤肉等众多美食，可用来加热食物就不大适合了。烤箱一般也会比微波炉多花一倍的时间，耗电量也大，微波炉的目的其实就是为了快速翻热食物，能节省很多时间。当然，网上有很多微波炉做菜的菜谱，采用专门针对微波炉的烹饪方法和技巧，也能做出不少好吃的菜。