1、营养不良。长时间辟谷会导致因食物中蛋白质和能量摄入不足引起营养不良，表现为疲乏软弱、消瘦、发育受影响、肤色黄而粗糙并有弹性减低、贫血等。
2、内分泌失调。长时间辟谷可能会使体内的激素代谢紊乱，导致内分泌失调，出现烦躁、情绪不稳定、月经期紊乱、月经量少等症状，严重者可能还会出现闭经的情况。
2、反应迟钝。长时间辟谷导致营养物质摄入不足，使得以葡萄糖为主要养分的脑细胞活力不足，会出现疲倦、精神欠佳、反应迟钝等表现。
3、消化道疾病。长时间辟谷，即不进食或少量进食，一方面会使得胃酸分泌刺激胃黏膜，导致胃黏膜受损；另一方面也可能导致胃肠蠕动不规律，容易引起腹痛、腹胀、便秘等症状，长此以往还会引起胃炎、胃溃疡等消化道疾病。
4、体重增加。长时间辟谷会压抑食欲，当恢复正常饮食后可能因为食欲旺盛，导致食物摄入过量，从而出现体重增加的情况。