1、用途不同：西芹：一般比较干，而且比较香，多做香料使用；芹菜：一般比较多水分，只是作为蔬菜的一种来使用。香芹：可生食或用肉类煮食，也可作为菜肴的干香调料或做羹汤及其他蔬菜食品的调味品。
2、外形不同：西芹有一种特殊的味道，略像药味，所以我们那边又叫它药芹，西芹比普通芹菜粗,茎叶都是是碧绿色的,而普通的芹菜比较细，下半茎部是白色的，叶子和上半部分是绿色的。香芹是伞形花序多分枝，伞梗上端有短硬毛，复伞形花序直径2-7厘米。
3、出处不同：原产地中海沿岸，原名西芹。我国栽培芹菜，据说已有两千多年的历史。芹菜有旱芹和水芹两种，长吃的是旱芹，水芹只在南方才能吃到。芹菜的特点是株肥、脆嫩、渣少。芹菜分好多种，大体上可分为本芹、西芹、山芹、野芹。其中，本芹又分为水芹和旱芹两种，都是由保健作用的美食。水芹主要产于南方，旱芹主要产于北方。由于两种芹菜的生长环境不同，食疗功效也略有差别。香芹产地主要为黑龙江、吉林、辽宁、内蒙古、河南、山东、江苏等省区。