1、叶片区别。黄果茄单叶互生，叶片为卵状长圆形，长大概4-6厘米，宽约3-4.5厘米，先端钝或者尖，基部为近心形或者偏斜，边缘有深裂。黄果茄和刺天茄的区别：叶片区别，花的区别。刺天茄叶片为卵形，长大概5-7厘米，宽约2.5-5.2厘米，先端钝，基部为心形或者截形，边缘有浅圆裂，上面颜色为绿色，有短柔毛，下面为灰绿色，有长绒毛。黄果茄和刺天茄的区别：叶片区别，花的区别。
2、花的区别。黄果茄为聚伞花序生在腋外，通常情况下，3-5花，萼为钟形，外面有小的刺，花冠为辐状，颜色为蓝紫色，裂瓣为卵状三角形，子房为卵形圆形，花柱较纤细。黄果茄和刺天茄的区别：叶片区别，花的区别。刺天茄为蝎尾状花序，花的颜色也为蓝紫色，少数为白色，萼为杯状，裂片为卵形，子房为长圆形，有棱。黄果茄和刺天茄的区别：叶片区别，花的区别。
3、果实区别。黄果茄为球形，初期时果实为绿色并有深绿色的条纹，成熟后将变成淡黄色。而刺天茄成熟时为橙红色。