1、设置不同：Eclipse在工程浏览视图或者包浏览视图可以看到并使用链接编辑器的按钮。idea在工程视图或者包视图选择设置，勾选根据源码自动滚动功能。
2、内存占用：IDEA需要使用更多的系统资源，比Eclipse更耗费内存。
3、来源不同：Eclipse是允许安装第三方开发的插件来使自身的功能得到扩展和增强的，而Myeclipse就是其中的一种有名的插件集之一，MyEclipse是收费的。
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