1、按照植物进化和分类系统排列布局的分区，称为植物进化系统专类区，或称系统园、树木园等。该专类园以植物分类学为理论基础，依据一定的分类系统，将植物按照进化顺序排列布置，反映了植物界由低级到高级发展进化的过程。它可以任何等级上的一个分类单位为基础，如一个纲、目、科、属或种。目前运用较多的分类系统有Engler(恩格勒)系统、Hutchinson(哈钦松)系统、Cronqust(克朗奎斯特)系统、Hutchinson(哈钦松)系统、Takhtajan(塔赫他间)系统等。
2、按照植物地理来源布置的专类区以植物地理学为基础。收集来自世界各地某些地区的植物。该专类区，往往是要展示具有特别趣味的植物类型及其原产地和分布情况，比如澳大利亚的山龙眼科植物、马达加斯加岛的棕榈科植物、热带美洲的附生凤梨科植物、西南欧的球根植物等。按照植物地理来源或以植物区系布局的专类园，可以增进人们对世界各地植物种类、植被类型及所依附的自然地理条件的认识，加深对世界各地植物资源的了解。
3、按照植被类型布局，所谓植被类型，即在不同的地理环境和不同的气候条件下，根据植物与植物、植物与环境之间的.相互关系所形成的不同的植物群落。大多植被类型专类区，是为了保护展示当地本土植物而建立的，目的是指导重建和恢复真正的自然生境，具有一定的科学意义。例如，古巴哈瓦那国家植物园的蛇纹岩地区植被;我国吉林长春森林植物园的长白山地区植被，西双版纳热带植被，湖南南岳植物园的低丘陵植被等。
4、按照植物生长所处生境布局该专类区，通过运用适合在同一生境下生长的植物造景，来表现此生境特有的植物景观。表现的主体是植物，表现主题则是不同类型的生境。根据植物对其主要影响环境因子要求的不同，形成了多样的专类园。其中，根据植物对水分的不同适应性，可分为水生植物区、湿生植物区、中生植物区、旱生植物区;根据植物对不同土壤的要求，有岩石园、盐生园、沙漠植物区、沙旱生植物区等;根据光照和温度条件的不同，有阴生植物区、高山植物区等。
5、按照亲缘关系相近原则布局，将亲缘关系相近的植物，如同科或亚科、同属、同种作为分类标准，进行布局而组成的植物专类区。其中同种植物专类区，是由该种植物的不同品种及变种组成。这类专类区(园)的主题植物在花期常有较高的观赏价值，如梅园、菊圃、牡丹园、月季园、荷园、樱花园、桂花园等。植物园中同种植物专类区的数量相对较少，多半会引入其他亲缘关系相近的种，组成同属植物专类区。