1、脾胃虚寒的人群。苦瓜味苦性寒，多吃对胃肠道有刺激作用，特别是平时体质较差或怕冷、脾胃虚寒等寒性体质的人，大量吃苦瓜可能会加重状况，导致胃疼、腹痛，甚至腹泻，因此脾胃虚寒的人群不宜多吃，而且不能天天食用。
2、低血糖者。低血糖的人不要吃苦瓜，因为苦瓜有很强的降血糖的作用，这是由于苦瓜中含有一种类似胰岛素物质的缘故，其效果比现用降血糖药“甲磺丁脲”还强，因此苦瓜不适宜低血糖人群食用，以免造成血糖偏低导致出现意外。
3、缺钙的人。苦瓜中的草酸会妨碍食物中的钙吸收。因此，在吃之前应先把苦瓜放在沸水中焯一下，去除草酸。对于身体已经缺钙的人群最好是不要吃苦瓜。
4、学龄前儿童。由于儿童的生理特点，中医认为小儿为纯阳之体，胃常有余，而脾常不因此过食苦瓜易伤儿童的脾胃功能，因此学龄前儿童不宜过食苦瓜。
5、生理期女性。女性在生理期最好不要过多食用苦瓜，尤其是寒性痛经的朋友，因为多吃可能使气血受寒而凝滞，影响月经的顺畅。
6、孕妇。孕妇胃肠蠕动较慢，苦瓜对于改善孕妇的消化吸收、增进食欲等方面都有好处，但苦瓜内含有奎宁，奎宁有催产作用，可通过胎盘，引起胎儿听力损害及中枢神经系统、四肢的先天缺损，为慎重起见，孕妇还是少吃苦瓜。