1、颜色区别：黄西瓜和红西瓜最主要的区别就表现在它们的颜色上，虽然在没有切开的时候它们表面都是绿色，但切开后会发现黄西瓜的瓜瓤黄色或淡黄色的，红西瓜的瓜瓤则为红色或淡红色。
2、体积区别：通常情况下仔细观察会发现红西瓜的体积一般都比较大，重量也比较重，而黄西瓜是从台湾引来的新品种，体积一般比较小巧，重量较红西瓜来说比较轻，因此黄西瓜和红西瓜体积上有一定区别。
3、营养价值：黄西瓜和红西瓜在营养价值上也有一定区别，黄西瓜的含糖量比较高，维生素含量含量较低，而红西瓜的含糖量相对于黄西瓜较少，果酸和维生素含量却比较高，两者食用后都能为人体补充能量、消暑除烦、减轻疲劳，但所补充的营养却是不一样的。
4、口感区别：黄西瓜虽然看上去比较有吸引力，营养价值也很高，但毕竟黄西瓜是新引进的品种，体积比较少，含水量没有红西瓜多，其次，红西瓜含有大量的番茄红素，而番茄红素会在一定程度上提升红西瓜的口感，所以黄西瓜的口感比红西瓜差一些。