1、腐生。从动植物尸体上或无生命的有机物中吸收养料的食用菌为腐生菌。绝大多数食用菌都营腐生生活，在自然界中有机物质的分解和转化中起重要作用。腐生包括只营腐生生活的专性腐生和以寄生为主兼营腐生的兼性腐生。大多数细菌、放线菌、酵母菌和霉菌以及食用菌都营腐生生活。腐生菌较易培养，目前能人工栽培的食用菌都是腐生菌。
2、寄生。生活于寄主体内或体表，从活着的寄主细胞中吸取养分进行生长繁殖的食用菌为寄生菌。在食用菌中，只能寄生在活的寄主上的转性寄生十分罕见，多为兼性寄生或兼性腐生，以腐生为主、兼营寄生的为兼性寄生，以寄生为主、兼营腐生的为兼性腐生。专性寄生的典型代表是星孢寄生菇，它专门寄生在稀褶黑菇的子实体上，并在寄主的子实体上产生自己的子实体，形成“菇上菇”现象，该菌又称蕈寄生菌。兼性寄生菌的典型代表是蜜环菌，它可以在树木的死亡部分营腐生生活，一旦进入木质部的活细胞后就转为寄主生活，常生长在针叶或阔叶树干基部和根部。
3、共生。与相应生物生活在一起，形成互利互惠、相互依存关系的菌为共生菌。食用菌与某些植物、动物及真菌之间都存在着共生现象。菌根菌是食用菌与植物共生的典型代表；食用菌的菌丝与植物根结合成复合体——菌根。菌根能分泌吲哚乙酸等生长激素，刺激植物根系生长，并且菌丝还能帮助植物吸收水分和无机盐，而菌根植物则把光合作用合成的碳水化合物提供给菌根菌。块菌科、牛肝菌科、口蘑科、红菇科、鹅膏菌科的许多种类如松口蘑、松乳菇、大红菇、铆钉菇、美味牛肝菌都是我国最常见的菌根菌。