1、个人所得税退税之后是不会有影响的，个税扣个人的，一般不会影响社保缴纳。个税(综合所得：包含工资薪金、劳务报酬、稿酬、特许权使用费)是通过个人应付工资扣减社保等支出、国家法定扣除、其他附加扣除后计算的数。
2、个税退税是因为现在综合所得方面采取的是平时预缴，年度汇缴的方式，在计算退税时一般不会影响缴纳社保所依据的基数。
3、个人所得税的起征点一般是三千五百元，如果是自然人的法定收入超过三千五百元的，超过部分才应当纳入税收范围，未超过部分则不纳税，需要注意的是个人所得税的纳税范围不仅包括工资，还包括奖金、节假日补贴、加班工资等部分。