1、新鲜的芡实在常温下最多只能保存3~4个小时，这是因为芡实在在拨开后有很多水分，放在常温下，会蒸发水分，产生变色并且发出馊味。所以最好的方法是将不用的新鲜芡实放到冰箱冷藏室冰冻起来。把新鲜芡实放入封口袋中，加入适量的水，封好。放入冰箱中冷冻起来。下次用的时候解冻出来还是新鲜的。没有剥壳的就放在冷藏箱但不能放久了，七天没有问题。
2、干芡实的保存方法。首先应将芡实芡实放在阴凉、干燥、通风较好的地方。另外，因芡实含有丰富的淀粉,在贮藏过程中有受到虫蛀的风险。可以在晒干的干芡实中加入几瓣生大蒜防虫害。一般是每千克芡实放入8~10瓣生大蒜，与芡实拌匀后装入缸内盖严，这样可以保持芡实在一至两年内不受虫蛀，这是比较好的保存方法。