1、常温保存。百香果可以直接放在干燥通风的位置常温保存，在这种环境下即使外壳会变得有点干，皱巴巴的，但是并不会影响果肉新鲜的口感，只是常温保存不宜长久，需尽快食用，时间久了还是会变质的。
2、保鲜冷藏。如果想更长时间的保存百香果，当然放入冰箱冷藏最好，尤其是已经切开没用完的半个百香果，最好用保鲜膜包裹放入冰箱冷藏，这种方式可以保持半个月左右，记得也要尽快食用。
3、冰冻保存。若剩下的百香果还有很多，那么可以将所有果肉取出，放进容器或模型里，冷冻成百香果冰块保存，这种方式能存一年左右，吃的时候拿出来温水冲开，加点蜂蜜，就能直接饮用。
4、加工保存。大量百香果可以加工制成果酱进行保存，这个过程需要对果肉进行简单加工，而且对存储容器的要求很高，需要进行高温蒸煮消毒处理，最后密封保存，相对复杂，所以还是建议大家按需购买，尽早食用。