1、形状区别。栉孔扇贝的外壳形状为扇形，两壳对称，外壳有微微凸起，壳薄而轻，非常适合进行快速游动，形状像裙摆，闭壳肌常被分成了两部分，被用来控制两壳的活动，而海湾扇贝主要为圆形，壳质薄，坚硬无比，后缘呈圆形，而且有状花斑，壳体呈灰褐色。
2、产地区别。栉孔扇贝主要产地在美国和加拿大，现在我国渤海、黄海、辽宁沿海地带也有分布，从产地来看，主要是光照充足，有温暖的海水，适合栉孔扇贝生长繁殖，而海湾扇贝在日本等地的沿海地带分布，那里的海水咸度较高，海湾扇贝繁殖率低。
3、营养价值区别。栉孔扇贝里面含有大量的氨基酸、维生素、核黄素、铁、钙、镁等营养，食用后，可以预防心血管疾病，抗菌，增强人体抵抗力，海湾扇贝里的营养含量比较少，主要包括蛋白质、维生素、钠、镁、锌、硒具有化痰、清热、滋阴补肾的功效。