一、调解协议的功能
如前所述，调解的优势和目的在于避免诉累，低成本地解决纠纷。因此，调解协议作为双方协商达成的解决方案的书面载体，在写法上应以该目的为导向，避免新的争议的产生，确保调解方案的可履行性，并强化其自动履行的可能。
为了实现这些功能，一份调解协议应当做到：1.通过充分声明或引入见证方，避免因事后反悔而根据《中华人民共和国合同法》第五十四条引发撤销或变更之诉;2.完整、严谨地将权利义务内容固定下来。权利义务内容应当合法、明确、具有可履行性;3.通过精确的表述，尽量限制对同一条款作出不同解释的空间，以避免引发新的争议;4.明确违约责任，通过设置增加违约方成本的条款，增加协议自动履行的可能;5.虽然调解的目的是一次性解决纠纷，但仍应预见到后续诉讼等程序的可能，协议中应确定一些基本要素，为其他纠纷解决途径减少障碍。
二、调解协议的结构及各部分注意事项
一份完整详尽的调解协议的结构可能包含：标题、纠纷各方的身份及授权、关键词定义、事由叙述、声明与保证、具体权利义务条款、权利放弃条款、违约条款、担保条款、见证条款、生效条件条款、管辖条款、调解协议的持有方及份数、清洁文本条款、签订时间和地点等等。根据纠纷的性质和复杂程度、纠纷主体的身份和关系的不同，并非每个项目都为必需，可根据具体情况予以取舍。
1.标题
调解协议的标题应当体现出该文件是纠纷各方经平等协商达成的一致意思表示，“调解协议”、“和解协议”等均可，也可进一步写明纠纷事由。
2.纠纷各方的身份及授权
调解协议中应当明确记载纠纷各方的身份资料。自然人至少需写明姓名、性别、出生时间、身份证件号码;法人或其他组织至少需写明名称、法定代表人或负责人、登记地址。相应的身份证件需复印作为调解协议的附件。身份资料记载不明的调解协议对义务方的约束力可能大打折扣，而如果调解协议最终不能自动履行，须经诉讼或仲裁等途径，后续的程序中也需要提供详细身份资料。
调解协议本质上属于合同，订立合同的主体将对合同的效力产生影响，易出现纰漏的地方主要是年龄、身份及授权。订立调解协议时需注意核实参与方是否具有就该纠纷进行调解、作出承担义务或放弃权利的实质性意思表示的能力及权限。法定代理人或委托代理人参与调解时，需记明代理人身份资料和授权权限。如有独立的授权委托文件，需与身份文件一并作为调解协议的附件，以免委托方事后否认。
为方便协议行文，通常在此部分将纠纷各方分别定为甲方、乙方等，后文则以甲方、乙方等指代。起草调解协议时需格外注意核对指代的一致性，以免在权利义务条款中因混淆而造成争议。
3.关键词定义
日常使用的词汇含义往往是不确定的，加之广义与狭义、术语与俗语等分别，极易出现不同解释，譬如“2013年之前”这个日常表述，有时意指2013年12月31日之前，有时意指2013年1月1日之前，在一方缺乏履行诚意的情况下，语词含义不明很可能导致新的纠纷。因此，在调解协议中对关键词进行详细定义是十分必要的。
如劳动争议纠纷，根据法律规定，劳动者可主张的项目很多，包括经济补偿、赔偿金、未签订书面合同的二倍工资差额、加班费等工资差额、高温津贴等等，如调解协议中仅约定用人单位向劳动者支付XX元“赔偿款”或“补偿款”，而没有对该款项所包含的项目进行详细定义，则有可能造成调解后劳动者再就其认为没有获得的项目进行申诉，而用人单位认为该项目包含在已给付款项中的争议。简单的调解协议可以直接在条款中对重要措辞进行补充说明，比较复杂的调解协议还需要在具体权利义务条款前单独设立条款进行定义。
4.事由叙述
调解协议中应对引发纠纷的事由进行明确叙述，以避免发生调解后权利方再重复主张，或义务方推脱协议是因其他事由而订立等情形。如机动车道路交通事故纠纷，至少需说明事故时间、地点、肇事方和受害方的姓名及车牌号码、大致事故后果等等;又如因拖欠货款而发生的纠纷，此部分应当说明欠款人及协议所针对的欠款期间。
视情况不同，此部分叙述繁简宜有所区别。有的纠纷不宜在此部分详叙经过，以免双方因对经过细节争持不下而导致协议无法签订，如离婚协议;而有的调解协议只是纠纷的部分解决，则可在此部分尽量明确事实甚至细节，为后续程序如诉讼等减少争议。事由叙述部分的措辞一般以理性、客观为宜，避免采取感情色彩较浓厚的词语尤其是贬义词语，以免激化纠纷各方的冲突情绪。
5.声明与保证
这一部分由于不涉及实体的权利义务，在订立调解协议时容易被忽略，实际上，声明与保证是巩固调解协议效力的一大要素，因为根据《中华人民共和国合同法》第五十四条，“因重大误解订立”、“在订立时显失公平的”、“一方以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立的合同”，可以请求法院或仲裁机构变更或撤销。
现实生活中，为了尽快得到赔偿，受损方可能接受调解，收取赔偿款后再依据上述规定向法院起诉要求撤销或变更原调解协议，以期获得更多赔偿，尤其在人身侵权案件中，这类情况时有发生。但是，如果实际上并不存在重大误解、显失公平等情况，仅仅是为了多索取赔偿款而反悔，这有违诚信，增加诉累，也会极大地阻却人们选择调解方式来自行解决纠纷的意愿。因此，在调解协议中，应当针对调解协议订立时的平等、自愿、正确认知等要素作出充分的声明与保证，尽量避免给滥用上述法律规定获取不当利益的企图留下漏洞。
根据相关解释，所谓“重大误解”，是指误解者作出意思表示时，对涉及合同法律效果的重要事项存在着认识上的显著缺陷，其后果是使误解者的利益受到较大的损失，或者达不到误解者订立合同的目的。这种情况的出现是由于行为人自己的大意，缺乏经验或者信息不通而造成的，故调解协议中需要确认纠纷各方都明知且正确理解了纠纷相关的法律规定，例如在人身侵权纠纷中，调解协议需要说明伤者对自身伤情已有充分了解，并知悉赔偿的法定项目和标准。
“显失公平”是指一方当事人在紧迫或者缺乏经验的情况下订立的使当事人之间享有的权利和承担的义务严重不对等的合同。显失公平制度具有客观要件和主观要件两方面的要求，即在客观上当事人之间的利益不平衡，且主观上一方当事人故意利用其优势或者另一方的草率、无经验等订立了合同。因此，调解协议中需要注意权利义务条款的平衡性。如果调解协议中纠纷各方权利义务实质上是相当的，但由于有的权利或义务没有在协议中表述出来，或者是隐性的，进入诉讼时在协议中表面上占据优势的一方便会处于被动。如某一方放弃权利较多，最好在协议中声明其意思表示是在明确知悉并充分考虑调解方案法律后果与自身实际情况的前提下作出的。
“以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危”的情形较为特殊，如果调解协议订立过程中确实存在欺诈、胁迫或乘人之危的情形，仅书面进行声明并不能有效排除这种情形的存在，因此声明的意义不大。司法实践中通常要求主张存在这种情形的一方就此进行举证，对协议产生效力影响的可能相对较小，在此不予赘述。
在协议内容是否属于当事人处分权的范畴、当事人争议的法律关系是否涉及到协议外第三方的.权益、协议指定处分的财产上是否存在协议外第三方权利等问题上，也需要明确的授权和声明，相关文件如权属证明需作为调解协议附件。
当然，以上绝不意味着在调解中占有实际优势的一方可以迫使对方达成调解，并利用声明与保证条款规避相应的法律后果。声明与保证并不等同于签订方放弃了请求变更或撤销调解协议的权利，它的作用是通过充分的声明与保证，使参与调解的纠纷各方诚信、谨慎地进行调解，减少事后反悔的几率。处于弱势地位的一方如果认为在调解中受到了不当压力，可以选择诉讼途径，通过向法院申请先予执行、财产保全、减缓免诉讼费用等一系列措施降低诉讼成本、尽快得到赔偿款项。
6.具体权利义务条款
具体权利义务条款是调解协议的核心，应当注意其合法性、平衡性、可履行性及明确性。
合法性是调解协议有效的前提。拟定调解协议时，需确保协议不存在侵害国家利益、社会公共利益和他人的合法权益的情形，不存在违反法律、行政法规的强制性规定的内容，亦不应违背善良风俗和社会公共道德。
有一案例，被侵权人患病，侵权人在没有取得医生执业资格的情况下，在侵权人家属经营的诊所为其诊治。后被侵权人病情加重。双方遂签订了协议约定侵权人家属向被侵权人支付补偿款，被侵权人收款后自愿请求公安机关放弃追究侵权人家属及侵权人的刑事责任和其他行政责任，双方终结本事故任何责任，互不追究。双方并就补偿款的付款方式达成如下约定，侵权人家属将补偿款交给当地法律服务所保管，待侵权人被释放之日，双方到法律服务所办理领款手续;如侵权人不能被公安机关及相关机关释放的，侵权人家属能提供侵权人的刑事拘留证明文件的，该保管款由法律服务所退回给侵权人家属，被侵权人法定代理人对此无异议。侵权人家属向法律服务所交付了补偿款，后侵权人因涉嫌非法行医被刑事拘留，法律服务所将补偿款退回了侵权人家属。侵权人被逮捕后，鉴定结论证实侵权人的诊疗活动与被侵权人的身体损害不存在因果关系，检察院因证据不足对侵权人作出不起诉决定。被侵权人据上述协议起诉侵权人家属、侵权人，要求二人按协议连带支付补偿款。本案终审认为案涉协议以公安机关是否放人作为付款条件，将应否付款系于公权力是否行使，具有非法射幸性质，违反公序良俗，属于损害社会公共利益的合同，认定其为无效。
应当注意的是，合法性不止是指不违反法律，也包括协议表述最好能与法律法规等规定保持一致。如有调解协议中约定如遇政策调整等不可抗力则无需履行，由于政策调整是否属于不可抗力存在很大分歧，如此约定有可能带来争议，最好直接表述为如遇政策调整则无需履行该约定。
平衡性关系到协议是否可能以“显失公平”为由而被变更或撤销，如前所述，不再重复。
可履行性和明确性是息息相关的，权利义务内容应当尽可能地完整、详尽，包括但不限于履行时间、履行方式、经办人、给付内容、履行步骤、催办条件、履行证明等等。
例如一个拖欠货款纠纷，A企业与B企业的经营者经协商订立了简单的还款协议，但协议中仅写为：“现欠A企业XX元”，其下列明了各期还款日期和数额，由B企业经营者签名，未加盖公章。后履行发生争议，A企业主张B企业经营者承担连带还款责任，B企业经营者拒绝，称其签字仅为职务行为。此类争议如协议稍加说明即可避免。
在拟定具体权利义务条款时容易出现的疏漏是不注意细节和步骤，如有一调解案例约定甲方向乙方支付款项，乙方协助甲方办理证件，但未约定先后顺序和具体协助方式，给履行造成新的争议;又如约定履行时间为XX日之内，但未明确是自然日还是工作日，起算时是否包括当日等等细节。