1、科属区别：鲅鱼和马鲛鱼虽然都是硬骨鱼纲与鲈形目中的鱼类，不过具体所属的科是不同的。鲅鱼所属的科是鲅科，而马鲛鱼所属的科则是鲭科。
2、体型区别：有时候二者的体型是基本相同的，不过稍微有一些差异。鲅鱼在成年之后的身体长度范围是在25-50厘米之间。与之相比，马鲛鱼的体型会稍微大一些，不过有时候也是不太明显的，因为不同个体的体型是有较大差异的。
3、外观区别：若是仔细观察的话，可以发现二者在外观上也有细微的差异，比如它们的颜色。二者相比，鲅鱼的头部颜色有些偏暗红色，马鲛鱼的则是淡蓝色的，当然有时候也比较难区别。另外，它们的牙齿也有一定的牙齿，二者相比还是鲅鱼的牙齿更锋利一些，相对来说捕食的能力也会强一些。